新乡医学院三全学院于2003年获批举办，同年12月份，被教育部确认为独立学院。2009年2月，新乡医学院与中美集团签订合作办学协议，推动学校发展迈入新阶段。
学校推行“书院+院系”的“双院制”全新育人模式。目前设有基础医学院、护理学院等15个专业院（系、部），仁智、羲和等6个英式住宿制书院，教务部、学务部等30个职能部门。现有全日制本科（含专升本）、专科2个办学层次，24个本科专业及方向、9个专科专业，涵盖医、管、理、工、文5个学科领域。在校生共22334人，专任教师1188人。专任教师中副高占比31％，研究生学位人员占比42％。学校推行“人才强校”战略，外聘高校和行业、企业专家共260人。
学校现有两个校区，分别位于新乡市区和平原示范区。新乡校区是新乡市的花园单位，平原校区建设项目被列为省重点建设项目，两校区共占地1891亩，校舍总建筑面积为64.8万平方米，实验室共42类226间，教学、科研仪器设备值2亿元。
学校秉承“全面适应社会需求，全面实施素质教育，全面培育医学英才”的办学指导思想，坚持“建设地方性、高水平、有特色、应用型的健康服务大学”的发展目标，坚定“转型发展、内涵发展、特色发展”的中期发展战略，紧握“健康中国”“健康中原”战略与教育领域综合改革的重要机遇，突出办学特色，构建了以现代医疗服务为核心，以现代医疗装备与技术、生物医药、养老与康复、现代健康与医疗管理为两翼的覆盖全生命周期的五大健康服务专业集群，积极为地方经济社会发展提供人才保障和智力支持。办学十六年来，先后培养了36011名优秀毕业生，已逐步成长为一所特色鲜明、优势突出的新型高等院校。
按照“合作一个企业，建设一个集群，打造一个模式，创造一个品牌”的思路，学校近年来转型发展成果显著。
专业建设成果突出护理学为河南省一流本科专业建设点，本科临床医学、护理学、眼视光学、康复治疗学、医学检验技术、生物医学工程、医学影像技术7个专业获批为河南省民办普通高等学校品牌专业，临床医学、护理学、康复治疗学、眼视光学4个专业获批为河南省综合改革试点专业。生物制药、假肢矫形工程、助产学、健康服务与管理、数据科学与大数据技术、智能医学工程6个专业为国家特设专业，康复辅助器具技术专业为国内首批开设专业，口腔医学技术、眼视光学、智能医学工程、假肢矫形工程、医疗产品管理5个专业为河南省唯一开设的本科专业，健康服务与管理、助产学2个专业是河南省首批招生的专业。
实验实训中心建设成效卓著35000㎡生物与基础医学实验教学中心、5000㎡国际护理实践教学中心是“河南省示范性实验教学中心”；20000㎡医学工程实训大楼投入使用，涵盖工科基础、医学影像技术、智能医学工程3个综合实训平台，口腔医学技术和假肢矫形工程2个生产性教学工场，教学科研仪器设备总值达7800万元；设有2500㎡医养康护综合实训中心，2000㎡眼健康智慧学习中心，500㎡生物发酵工程中心；与美国南加州大学合作共建2000㎡干细胞中心和科研创新中心；筹建2500㎡人体科学智慧学习中心。
产教融合、校企合作不断深化先后与东软集团、凯普生物、等十余家大型行业龙头企业签订合作协议，与翔宇共建康复医疗研发与应用协同创新中心，与沈阳东软医疗系统有限公司签订深度合作一揽子协议并建成东软首个影像云地方服务中心，推动校企合作向产教融合转变，不断探索传统医疗行业转型升级和新兴产业发展中人才培养模式改革和技术创新。开展“翔宇班”、“凯普班”等8个跨专业编成和联合培养订单班,按专业集群组建光明眼科学院、口腔技术学院、康复学院3个行业学院，产教融合人才培养模式和机制改革持续深化。与新郑市人民医院等22家县级医疗单位联合组建河南县域医疗单位合作联盟，牵头26家基层医院组成河南基层卫生人才医教协同发展联盟，探索建立政、产、学、研、用协同创新发展的良性循环之路，服务区域发展水平连上新台阶。
国际化发展迈入新征程2015年，学校获聘请外国专家单位资格认可证书，先后引进美国加州大学戴维斯分校李明文教授，组建辅助生殖医学科研团队；聘请美国南加州大学应其龙教授为干细跑中心首席科学家，开展干细胞转换利用研究；聘请韩国新丘大学崔锡淳、文秀教授，开展口腔医疗技术人才培养改革和高端口腔产品应用性研究。2017年，获批招收外国留学生资质，是全国独立学院中，第一家具备该项资质的高校，目前已有118名来自巴基斯坦、印度、印度尼西亚、坦桑尼亚、加纳等“一带一路”沿线国家学生入校学习；2018年，成功加入世界医学院校名录；2019年5月，获批与美国查塔姆大学合作办学项目；2020年5月，获批与英国贝德福特大学合作办学项目。我校为世界高等教育数据库成员，实现了“资源引入”与“教育输出”的协同发展。
成人高等教育全面启动2018年6月，成功获批举办高等学历继续教育资质，是全国独立学院中，第一家具备该项资质的高校。目前共开设护理学、医学检验技术、生物技术、生物医学工程、公共事业管理、医学影像技术、口腔医学技术、眼视光学、药学9个本科专业及护理学1个专科专业。获批河南省首批卫生健康行业职业技能鉴定站、河南省唯一的眼视光定配工验光员中高级职业技能鉴定站，获批健康管理师、口腔修复制作工（中、高级）鉴定资质。
科技创新能力不断提高学校获批为“2019-2021年硕士学位授予立项建设单位”，是河南省独立学院中，第一家具备该项资质的高校。学校是“国家自然科学基金依托单位”，细胞生物学学科获批为河南省重点培育学科，河南省山楂综合利用工程研究中心获批为省级科研平台、新乡市工程技术研究中心，药物及其关键中间体中心获批为新乡市工程技术研究中心，生育力保存重点实验室获批为新乡市重点实验室。2000㎡全开放科技创新中心平台、生物与基础医学实验平台、干细胞研究中心相继建成。
数字化校园建设与现代教育技术发展日臻完善建成网上办事服务大厅、智慧校园APP。以智慧学习工场为核心的现代生命科学学习中心正式启动。25000㎡图书馆投入使用，目前馆藏文献量已达到168万册，数据库7个。拥有省内领先的微课录播室，运行线上课程95门、微课1079个、微课群106组，连续三年获得河南省精品在线开放课程立项与全国教育教学信息化优秀组织奖。成立智能医学研究院，构建“人工智能+”人才培养新模式，自建虚拟仿真资源，获批新乡市智能VR康复训练系统工程技术研究中心、新乡市智能医学虚拟重点实验室、教育部协同育人项目，获首届全国大学生智能技术应用大赛一等奖。心脏VR项目参加河南省高校院所首届博览会并受到中央电视台等多家媒体报道。
招生与就创业质量不断向好学校录取分数线逐年提升，连续八年本科批次理科录取线超出河南省控线40分以上，医学及医学相关专业最低录取分数线均高出分数线40分以上，稳居河南省同类院校首位。学校为“河南省创业教育实训项目试点院校”；毕业生就业率常年保持在95%以上，各类升学率保持在30%以上，在全省全科医师规培的占有率达2/3。在第三方评价机构麦可斯与河南省教育厅共同发布的就业数据中，6项指标居全省同类院校第一。
办学成果日益丰硕，社会影响力持续增强2014年底，学校获准加入应用技术大学（学院）联盟，是全国唯一一所加入该联盟的医学类独立学院。近年来，学校荣获“河南省文明学校”等百余项荣誉称号，办学成果在中央电视台“新闻联播”、《中国教育报》等权威媒体进行专题报道。2019年9月，武书连2019中国高校排行榜发布，学校居河南省独立学院综合实力第一名、位列全国医药类独立学院第一名。2020年4月，“金平果”2020年中国独立学院竞争力排行榜发布，在全国261所独立学院中，学校居河南省独立学院综合实力第一名、全国医药类独立学院第一名、全国独立学院综合竞争力第22名。