自治区级重点学科“人口资源环境经济学”一个，“211工程”重点学科“中国新疆与中亚经济文化研究”，分子生物学、生物化学、细胞生物学为新疆大学重点建设课程。）。“应用数学与系统工程”为新疆大学“211工程”重点学科。重点建设学科：“新疆地区的信息技术”。自治区重点学科“计算机应用”。